2022年9月，实验室研究员陈鲲淇与西交利物浦大学黄戴赟、宋博文博士合作，发表研究论文：m6A-TSHub: Unveiling the Context-specific m6A Methylation and m6A-affecting Mutations in 23 Human Tissues，收录于国家重点期刊《Genomics Proteomics & Bioinformatics》杂志（IF=6.409，中科院分区1区）。该工作提供了在线平台m6A-TSHub，以揭示语境特异性（content-specific）的m6A甲基化和可能调控m6A表观遗传标记的基因突变。

m6A-TSHub由4个核心组成部分组成，包括：(1) m6A-TSDB：一个完整的数据库，包含来自23种人体组织的184554个功能注释的m6A位点和来自25种肿瘤的499369个m6A位点；(2) m6A-TSFinder：利用门选注意的多实例深度神经网络构建的用于从RNA序列中准确预测特定组织中m6A甲基化位点的web服务器；(3) m6A-TSVar：评估遗传变异对组织特异性m6A RNA修饰影响的web服务器；(4) m6A-CAVar：一个包含587,983个TCGA癌症突变(来自27种癌症类型)的数据库，这些突变被预测会影响癌症原发组织中的m6A修饰。该数据库为研究特定组织(或癌症类型)中m6A甲基组和表转录组紊乱的遗传因子提供了有用的资源。

消化道恶性肿瘤教育部重点实验室为该论文的第一单位，陈鲲淇为本文最后通讯作者，该工作得到国家自然科学基金、j9九游会以及西交利物浦大学的资助。

原文链接：https://doi.org/10.1016/j.gpb.2022.09.001